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科创投集团下属生物芯片公司timsTOF Pro 平台顺利完成安装调试,现已投入试运行

发布时间:2021-09-23

     

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      9月22日,上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心(以下简称SBC)最新引进的布鲁克timsTOF Pro液质联用仪顺利完成安装调试并正式投入试运行,平台同时搭载纳升液相,打造基于离子淌度分离的4D蛋白质组学分析体系。

     利用质谱仪开展的蛋白组学研究中,质谱的扫描速度会影响蛋白的鉴定深度。与传统3D蛋白组学保留时间、质荷比、离子强度相比,timsTOF Pro双TIMS/PASEF分离技术,使得蛋白质组学进入4D蛋白质组学新时代。
     4D分离技术增加第四个维度--离子淌度(mobility),进而大幅提高扫描速度和检测灵敏度,提升蛋白鉴定的数量和覆盖率。


引领4D蛋白组学研究


4D-shotgun

蛋白全谱分析,可用于IP/pull down之后的蛋白成分鉴定,对表达蛋白种类进行定性分析。

4D-labelfree

不需要对样品进行任何标记,每个样品可单独上机。利用DDA采集模式分析直接酶解后的蛋白肽段,获得蛋白质表达量变化情况,对蛋白进行定性定量分析。

4D-labelfree修饰蛋白检测

富集修饰蛋白进行鉴定及定量研究,可分析蛋白磷酸化、乙酰化等各种修饰组学,获得修饰程度信息。

4D-DIA

与Labelfree同属于非标记蛋白组学技术,但使用DIA采集模式替代DDA采集模式,不涉及对肽段的限制性筛选,因此具有更好的定量准确性,适用于复杂体系、海量样品的差异检测。

4D-PRM

可对目标蛋白质(或肽段)进行绝对定量分析的靶向蛋白质组学技术,用于验证大规模蛋白质组学几十个到上百个蛋白质的定量结果,通量高,灵敏度好。

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生物信息分析


多组学联合分析

系统生物学涵盖包括基因组、转录组、蛋白组、代谢组等多个层面,多个组学数据联合分析更深刻理解生物过程和分子机制。

大队列分析

Machine learning算法评估队列规模,集成Machine learning算法对单组学及多组学进行训练和建模,并评估性能,以此来筛选诊断或预后的Biomarker。